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公司动态

探秘黑胶虫(上)

2023-05-18

黑胶虫污染是一个老生常谈的话题。目前,科研界对黑胶虫的污染特征没有统一的判定标准,通常污染特征总结有:

1)活跃游动或旋转梭动或原地颤动

2)呈杆状、球状、卵圆状;

3)培养基不浑浊;

4)复苏或传代时往往会出现黑胶虫污染,并且与细胞呈现此消彼长的现象。

我们对多个黑胶虫样本进行测序鉴定,这里举两个典型鉴定结果给大家分享:



图1 Sphingomonas(鞘氨醇单胞菌)单个及菌落图

属名 样本2,15,21,27鉴定为Sphingomonas sp.(鞘氨醇单胞菌属)
能否游动 以单侧生极性鞭毛运动
类别 G-菌
形状 杆状;菌落为黄色
大小 0.3-0.8 * 1.0-2.7μm
特点 该菌属至今共有12个种,是一类丰富的新型微生物资源,可用于芳香化合物的生物降解,在环境保护及工业生产方面具有巨大的应用潜力
分布范围 河水、根际、地表及深层的地下的沉积物、海洋,甚至极地土壤中都有它们的踪迹


图2 Brevundimonas vesicularis(泡囊假单胞菌)单个及菌落图

属名 样本4,19鉴定为Brevundimonas vesicularis(泡囊假单胞菌)属于Brevundimonas sp.(短波单胞菌属)
类别 G-菌
形状 杆状;菌落为圆形,凸起,表面湿润光滑,边缘整齐
大小 0.4-0.5X 1-2μm
代表种 泡囊短波单胞菌是一种较罕见的非发酵性病原性假单胞菌,在人体可引起肺炎、败血症、皮肤炎症和坏死性蜂窝织炎等
分布范围 通常存在于土壤、河流等自然界中


这些黑胶虫样本被鉴定为细菌。另外我们也查阅了大批文献,十几年前就有人做了相关研究,很多都鉴定为细菌,例如以下这篇[1]



图3 客户文献截图


这篇文章讲述的是,首先从黑胶虫污染细胞样本中分离得到黑胶虫,然后从黑胶虫中提取基因组
DNA进行基因测序及分析,鉴定出的黑胶虫为无色杆菌属(Achromobacter)

细菌已经在地球上存在三十多万年了,具有不同的形状,根据形状主要分为三类,即:球菌、杆菌和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺杆菌)(图4)。鞭毛是着生在细菌表面的丝状运动器官。由于鞭毛很细,只有用特殊的染色法,才能用光学显微镜观察到。直径12~25nm,长3~12μm,柔软、波形(图5)。


图4 细菌模式图和细菌形状分类

 


图5 细菌鞭毛分布图

单生(一根鞭毛着生于一端)

双生(两根鞭毛分别着生于两端)

单丛生(一丛鞭毛着生于一端)

双丛生(两丛鞭毛分别着生于两端)

周生(多根鞭毛遍布于菌体上)

 

鞭毛有三种运动方式:在液体中泳动,在固体表面上滑行,在液体中旋转梭动。所以难怪,我们看到的黑胶虫不是在液体中活跃游动,就是在液体中旋转梭动,这就和黑胶虫被鉴定为细菌的结果相吻合了。

黑胶虫污染顽固,如何消杀,胞胞巴适有秘方——黑胶虫清除剂,其所含有的多肽活性成分,相比传统抗生素有效清除黑胶虫;清除周期短,视黑胶虫污染程度通常3-6天可有效根除;广谱性强,可有效清除常见支原体污染。




本期讲解就到这了,请持续关注爱必信公众号,等待探秘黑胶虫(下)。

[1] . Got black swimming dots in your cell culture? Identification of Achromobacter as a novel cell culture contaminant[J]. Biologicals, 2010, 38(2):273-7.

注:图源网络和客户,仅供参考学习用。



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500ml

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500ml

高糖DMEM培养基

500ml

RPMI-1640培养基

500ml

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500ml

Ham's F-12培养基

500ml

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500ml

DMEM/F-12培养基

500ml

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500ml

D-PBS缓冲液(不含 Ca2+ Mg2+

500ml

D-PBS缓冲液(含 Ca2+ Mg2+)

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Hanks平衡盐溶液(不含 Ca2+ Mg2+)

500ml

Hanks平衡盐溶液(含 Ca2+ Mg2+)

500ml

胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),含酚红

100ml

胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),不含酚红

100mL

无DMSO无血清细胞冻存液

100mL

无血清细胞冻存液

100mL

细胞冻存液(含血清)

100mL

组织保存液

100ml

组织冻存试剂盒

30ml

模具

1个/套

小刀

5片/包

组织复苏试剂盒

50ml

黑胶虫清除剂

200ul

卡那霉素B硫酸盐

250mg

硫酸庆大霉素溶液

10ml

青链双抗

100ml

青霉素-链霉素-庆大霉素混合溶液

100ml

两性霉素B

1g

制霉菌素

1g

青霉素-链霉素-两性霉素B混合溶液

100ml

支原体检测试剂盒

100T

支原体清除试剂

200uL×5

支原体预防

500uL×4

环丙沙星盐酸盐

500mg

水盘抑菌剂

20ml

水浴锅抑菌剂

100ml

培养箱除菌剂

480ml

细胞房除菌剂

480ml

 

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WB相关:ECL发光液、预染marker、预制胶;IHC相关:二抗试剂盒、组化笔;IP/CoIP试剂盒;激动剂/抑制剂;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡试剂盒;呼吸爆发试剂盒;ELISA试剂盒;重组蛋白;抗体: 二抗、标签抗体、对照抗体;定制服务(抗体/多肽/蛋白/标记/检测)...

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