黑胶虫污染是一个老生常谈的话题。目前,科研界对黑胶虫的污染特征没有统一的判定标准,通常污染特征总结有:
1)活跃游动或旋转梭动或原地颤动
2)呈杆状、球状、卵圆状;
3)培养基不浑浊;
4)复苏或传代时往往会出现黑胶虫污染,并且与细胞呈现此消彼长的现象。
我们对多个黑胶虫样本进行测序鉴定,这里举两个典型鉴定结果给大家分享:
图1 Sphingomonas(鞘氨醇单胞菌)单个及菌落图
属名 | 样本2,15,21,27鉴定为Sphingomonas sp.(鞘氨醇单胞菌属) |
能否游动 | 以单侧生极性鞭毛运动 |
类别 | G-菌 |
形状 | 杆状;菌落为黄色 |
大小 | 0.3-0.8 * 1.0-2.7μm |
特点 | 该菌属至今共有12个种,是一类丰富的新型微生物资源,可用于芳香化合物的生物降解,在环境保护及工业生产方面具有巨大的应用潜力 |
分布范围 | 河水、根际、地表及深层的地下的沉积物、海洋,甚至极地土壤中都有它们的踪迹 |
图2 Brevundimonas vesicularis(泡囊假单胞菌)单个及菌落图
属名 | 样本4,19鉴定为Brevundimonas vesicularis(泡囊假单胞菌)属于Brevundimonas sp.(短波单胞菌属) |
类别 | G-菌 |
形状 | 杆状;菌落为圆形,凸起,表面湿润光滑,边缘整齐 |
大小 | 0.4-0.5X 1-2μm |
代表种 | 泡囊短波单胞菌是一种较罕见的非发酵性病原性假单胞菌,在人体可引起肺炎、败血症、皮肤炎症和坏死性蜂窝织炎等 |
分布范围 | 通常存在于土壤、河流等自然界中 |
这些黑胶虫样本被鉴定为细菌。另外我们也查阅了大批文献,十几年前就有人做了相关研究,很多都鉴定为细菌,例如以下这篇[1]:
图3 客户文献截图
这篇文章讲述的是,首先从黑胶虫污染细胞样本中分离得到黑胶虫,然后从黑胶虫中提取基因组DNA进行基因测序及分析,鉴定出的黑胶虫为无色杆菌属(Achromobacter)。
细菌已经在地球上存在三十多万年了,具有不同的形状,根据形状主要分为三类,即:球菌、杆菌和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺杆菌)(图4)。鞭毛是着生在细菌表面的丝状运动器官。由于鞭毛很细,只有用特殊的染色法,才能用光学显微镜观察到。直径12~25nm,长3~12μm,柔软、波形(图5)。
图4 细菌模式图和细菌形状分类
![]() 图5 细菌鞭毛分布图 |
单生(一根鞭毛着生于一端) 双生(两根鞭毛分别着生于两端) 单丛生(一丛鞭毛着生于一端) 双丛生(两丛鞭毛分别着生于两端) 周生(多根鞭毛遍布于菌体上) |
鞭毛有三种运动方式:在液体中泳动,在固体表面上滑行,在液体中旋转梭动。所以难怪,我们看到的黑胶虫不是在液体中活跃游动,就是在液体中旋转梭动,这就和黑胶虫被鉴定为细菌的结果相吻合了。
黑胶虫污染顽固,如何消杀,胞胞巴适有秘方——黑胶虫清除剂,其所含有的多肽活性成分,相比传统抗生素有效清除黑胶虫;清除周期短,视黑胶虫污染程度通常3-6天可有效根除;广谱性强,可有效清除常见支原体污染。
本期讲解就到这了,请持续关注爱必信公众号,等待探秘黑胶虫(下)。
[1] , , . Got black swimming dots in your cell culture? Identification of Achromobacter as a novel cell culture contaminant[J]. Biologicals, 2010, 38(2):273-7.
注:图源网络和客户,仅供参考学习用。
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货号 |
品名 |
规格 |
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胎牛血清(特级) |
500ml |
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500ml |
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胎牛血清(标准级) |
500ml |
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高糖DMEM培养基 |
500ml |
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RPMI-1640培养基 |
500ml |
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MEM培养基 |
500ml |
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α-MEM培养基 |
500ml |
|
Ham's F-12培养基 |
500ml |
|
Ham's F-12K培养基 |
500ml |
|
DMEM/F-12培养基 |
500ml |
|
PBS缓冲液 |
500ml |
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D-PBS缓冲液(不含 Ca2+ Mg2+) |
500ml |
|
D-PBS缓冲液(含 Ca2+ Mg2+) |
500ml |
|
Hanks平衡盐溶液(不含 Ca2+ Mg2+) |
500ml |
|
Hanks平衡盐溶液(含 Ca2+ Mg2+) |
500ml |
|
胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),含酚红 |
100ml |
|
胰蛋白酶-EDTA消化液(0.25%),不含酚红 |
100mL |
|
无DMSO无血清细胞冻存液 |
100mL |
|
无血清细胞冻存液 |
100mL |
|
细胞冻存液(含血清) |
100mL |
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组织保存液 |
100ml |
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组织冻存试剂盒 |
30ml |
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模具 |
1个/套 |
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小刀 |
5片/包 |
|
组织复苏试剂盒 |
50ml |
|
黑胶虫清除剂 |
200ul |
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卡那霉素B硫酸盐 |
250mg |
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硫酸庆大霉素溶液 |
10ml |
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青链双抗 |
100ml |
|
青霉素-链霉素-庆大霉素混合溶液 |
100ml |
|
两性霉素B |
1g |
|
制霉菌素 |
1g |
|
青霉素-链霉素-两性霉素B混合溶液 |
100ml |
|
支原体检测试剂盒 |
100T |
|
支原体清除试剂 |
200uL×5 |
|
支原体预防 |
500uL×4 |
|
环丙沙星盐酸盐 |
500mg |
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水盘抑菌剂 |
20ml |
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水浴锅抑菌剂 |
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