JC-1氯化物是一种非常灵敏的荧光探针，用于检测Pgp活性。在细胞系中，红色发射带比其他类型更方便检测，如罗丹明123（529nm）或钙黄绿素（517nm）。JC-1本身作为单体（λem=527nm）在低浓度或低膜电位时呈现绿色荧光。而在更高的浓度（0.1uM以上的水溶液）或更高的电势时，JC-1形成了红色荧光聚合体，它具有广泛的激发谱和非常窄的发射光谱（λem=590nm）。JC-1用于活细胞中线粒体染色，包括细胞膜电位依赖的功能研究。JC-1已经被用于多药耐药性细胞的功能分析和细胞凋亡相关的线粒体修饰。